地区:
博瑞德
年份:
2020
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05
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20
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Identification of regulatory networks and hub genescontrolling soybean seed set and size using RNA sequencinganalysis用转录组分析识别控制大豆种子形成和大小的调控网络与核心基因Journal of Experimental Botany， IF= 5.8，2016.11摘要：为了识别控制大豆种子形成和大小的调控网络与核心基因，用转录组分析了三个早期发育时期的种子，用了两种基因型（大小相反的的种子），以大豆种子形成以及发育为基础这两组初步的数据为动态的基因表达网络提供了全面和系统的观点。利用两两比对和加权基因共表达网络分析，鉴别出了共表达和核心基因模块。尤其重要的是发现了大种子大小的变化和发育时期的特殊模块，大多数候选调控种子大小的调控因子包括参与激素信号途径和转录因子，在早期发育时期会瞬时和特异诱导。大豆油菜素类固醇信号受体酶同源染色体被认为是在种子早熟时期控制种皮网络的核心基因，过表达候选种子大小调控基因GmCYP78A5, 发现转基因大豆种子大小和重量都有所增加。总之，本文分析鉴别出了许多潜在的关键调控因子，控制大豆种子形成、大小、产量，因此，为理解大豆种子发育分子网络提供了新的视野。研究思路取材: 大种子品种豌豆28（V1） 、小种子品种Peixian Layanghuang (V2)，受精后5–7, 10–14, 20–24 天的种子即种子形成 (S1), 种子生长(S2), 种子早熟时期 (S3)这三个时期的样品，三个生物学重复。测序策略：PE100, Illumina HiSeq 2000文库构建：24个文库研究思路： 研究结果两个品种在S1，S2，S3时期种子的大小、形状、物质成份都有所不同，同一品种在这三个时期的种子也不相同，在S3时...