Genome-Wide Sequence Variation Identification and Floral-Associated Trait Comparisons Based on the Re-sequencing of the‘Nagafu No. 2’and‘Qinguan’ Varieties of Apple(Malus domestica Borkh.)
Front. Plant Sci., 27 June 2016，IF=4.495
通过重测序寻找长富2号和秦冠两品种之间开花相关性状差异位点
研究思路：
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研究结果:
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变异检测
变异在染色体水平分布不均匀 ；长富2号的SNP和SV比秦冠丰富
SNP转换远远多于颠换；SNP杂合的比例远远大于纯合比例，并且秦冠>长富2号![通过重测序寻找长富2号和秦冠两品种之间开花相关性状差异位点]( "通过重测序寻找长富2号和秦冠两品种之间开花相关性状差异位点")
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将SV变异分为六大类：DEL和INS是主要的SV；INX和INV是稀有SV
INS(Insertion)；DEL(Deletion)；IDE(Deletion including insertion)；INV(Inversion)；ITX(Intra-chromosomal Translocation)；CTX(Inter-chromosomal Translocation)
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注释结果表明具有不同基因组变异的基因的生物学功能对这些苹果品种的表型有显著不同的影响。
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Genetic linkage maps
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