Genome-wide association analyses provide genetic and biochemical insights into natural variation in rice metabolism
Nature genetics, IF=29.648, 2014.06
基于高通量测序对水稻代谢相关性状的全基因组关联分析
研究材料:529个不同水稻品种
测序方法:Illumina Hiseq 2000测序平台,
平均测序深度2.3×(1G/个体)
研究结果:
PCA及系统进化树发现群体可以明显地划分为两个亚群,后续在总群体及两个亚群中分别进行了GWAS分析
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得到重复验证的356个loci中,有161个显著影响已知的代谢产物,如氨基酸,黄酮等;有195个影响未知的代谢产物
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两个亚群中影响不同代谢产物的位点大多数不同
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候选基因筛选
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