基于重测序绘制水稻RIL群体遗传图谱
Dissecting yield-associated loci in super hybrid rice by resequencing recombinant inbred lines and improving parental genome sequences
期刊:PNAS
材料:
132株LYP9 RIL群体及其父本93-11,母本PA64s
方法:
Illumina Hiseq 2000测序平台,PE100
亲本测序36×和48× ,子代平均测序深度4×
结果:
![遗传图谱 遗传图谱]()
重测序寻找双亲间的SNP并构建子代遗传图谱,同时组装和改善双亲的基因组序列信息;
上图标记171847个SNP,构建了3524个bin,平均长度为105.6K;
![遗传图谱 遗传图谱]()
不同产量性状的QTL定位结果