建库测序是运用illumina测序平台对客户提供的合格文库直接进行测序，或者对客户提供的合格样品进行建库并测序，产出高质量的测序数据提供给客户进行生物信息学分析。生物信息学分析平台的构建，对分子生物信息数据能够快速获取；满足各种生物信息学分析所需的大规模计算能力；从互联网快速接入服务器并进行生物信息学分析。提供了集软件、硬件、数据库于一体的强大的生物信息分析平台。

测序数据分析服务

依托丰富的项目经验、强大的数据分析平台、专业的生物信息分析团队以及标准化的分析流程，提供完整的测序数据分析服务，可以为手中拥有一定数量的shotgun测序数据或序列数据的用户提供完整的生物序列数据挖掘与生物信息分析服务。

1、主要数据分析范围包括：

1）动植物基因组组装、重测序数据分析；

2）转录组数据分析、数字化基因表达谱分析、小RNA分析以及长链非编码RNA分析；

3）ChIP-seq分析、甲基化分析；

4）微生物基因组组装、宏基因组测序分析、环境微生物多样性分析等。

2、技术路线及分析流程

3、文库类型

4、建库类型及送样标准

公司建库类型：

自建库送样标准：

1）客户需要提供Qubit、NanoDrop、Caliper LabChip GX或者Agilent 2100中一种或多种形式的样品分析结果，推荐Agilent 2100；

2）浓度≥2 ng/ul, 体积≥20 ul；

3）表明建库试剂盒的来源，以及建库方法，接头序列及预期文库片段大小等信息，含index的文库需要给出index的位置和序列；

4）文库需要纯化；

5）文库注明溶剂成分；

6）Hiseq 2500与Miseq文库插入片段在600bp以下，Hiseq 4000插入片段在400bp以下，否则极大影响测序质量。

5、数据过滤标准

1、过滤接头；

2、当单端测序read中含有的N的含量超过该条read长度比例的 10%时，需要去除此对paired reads；

3、当单端测序read中含有的低质量（质量值Q≤10）碱基数超过该条read 长度比例的 50%时，需要去除此对paired reads。