新一代高通量测序技术和高性能的生物信息分析实现了表达谱分析的数字化、高效性,能够全面、快速地定量检测物种特定组织或发育时期的基因表达种类和丰度信息。
样品要求:总RNA≥1ug;RNA样品浓度≥50 ng/ul
测序策略:Hiseq2000单端测序(Single-End,SR 50bp) 。
项目周期:标准信息分析项目40天,个性化分析项目周期需根据分析需求另行评估
技术路线:
![数字化表达谱测序 数字化表达谱测序]()
分析内容:
标准流程
1) 对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads的处理
2) 测序评估(数据比对统计,测序饱和度分析,测序随机性的统计分析,Reads在参考基因上的分布分析
3) 基因表达注释
4) 差异表达基因分析
5) 差异基因表达模式聚类分析(需要客户确定对符合哪些条件的差异表达基因做聚类分析,例如,“在不同梯度的低温处理组之间皆有差异表达的基因”)
6) GO功能显著性富集分析
7) Pathway显著性富集分析
高级分析
1) 基因差异表达的聚类和热图分析(需两个或两个以上样品)
2) 基因差异表达的的趋势分析及显著趋势的基因模块的GO,KEGG富集分析(需多个样品)
3) 基因表达的主成分分析(寻找主效基因的统计方法)
4) 定制个性化分析和图表(按老师的要求定制,需要提供方案或者参考文献)